Odkażanie otoczenia rany należy wykonać za pomocą jałowych gazików nasączonych lekiem Octenisept od środka do wewnątrz rany.
Jeśli mamy do czynienia z zakażoną raną pooparzeniową czy owrzodzeniem żylnym, nasączamy gaziki lekiem Octenisept (tzw. przymoczki) i umocowujemy je za pomocą siatki gazowej lub bandaża dzianego. Gaziki takie zmieniamy raz na dobę, a w przypadku dużej ilości tkanek martwiejących - dwa razy na dobę. Pozostawienie gazików nasączonych preparatem w obrębie zakażonej rany pozwala na jej szybsze zagojenie się wskutek oddzielania się martwiczych tkanek.
W przypadku dezynfekcji skóry i błon śluzowych należy nasączyć jałowy gazik preparatem i zwilżyć nim odpowiednią partię skóry. Czas zwilżania to miniumum 1 minuta. Proces można maksymalnie wydłużyć do 5 minut. Leku Octenisept można użyć bezpośrednio z atomizera, rozpylając go na wskazane partie skóry czy błon śluzowych i pozostawiając na 1 minutę.
Podczas leczenia grzybic skóry, między palcami stóp, lek rozpylać na zmieniony chorobowo obszar rano i wieczorem przez 14 dni.
Lek Octenisept może być używany do irygacji pochwy przez 1 minutę. Możliwe jest tutaj rozcieńczenie preparatu jałową wodą w stosunku 1:1.
W przypadku chorób jamy ustnej, należy płukać ją roztworem 20 ml leku przez 20 sekund.